Zidentyfikowano do tej pory 2600 gatunków roślin, od gatunków alpejskich na stokach gór na północy po saharyjskie w Wadi Araba na południu. Izrael leży na północnej granicy występowania roślin takich jak papirus i na południowej, jeśli chodzi na przykład o peonię.
Naturalne lasy, złożone głównie z dębów palestyńskich, pokrywają część Galilei, Góry Karmel i inne górzyste tereny. Wiosną dominuje róż, biel i żółć posłonków i janowca kolczastego.
Krzewy oplata kapryfolium (wiciokrzew), a galilejskie strumienie ocieniają rozłożyste platany.
Na wyżynach Negewu z suchymi dolinami dramatycznie kontrastują potężne drzewa atlantyckiej pistacji. Wszędzie, gdzie pod ziemią znajduje się trochę wody, rosną palmy daktylowe.
Cyklamen
(fot. Biuro Prasowe Rządu / A. Ohayon)
Wiele kwiatów ogrodowych, takich jak irys, lilia biała, tulipan czy hiacynt, ma swoje dzikie odpowiedniki we florze Izraela. Wkrótce po pierwszych deszczach października czy listopada kraj pokrywa się zielonym dywanem, który znika wraz z początkiem suchej pory letniej. Od grudnia do marca kwitną różowe i białe cyklameny oraz czerwone, białe i fioletowe anemony, nieco później zakwita błękitny łubin i żółty złocień polny. Wiele lokalnych roślin, takich jak krokusy i cebulica, to geofity – magazynują substancje odżywcze w bulwach i kłączach, a kwitną pod koniec lata. Nad polami lata około 135 gatunków motyli, mieniących się wszystkimi barwami i wzorami.
W Izraelu można spotkać ponad 500 gatunków ptaków. Niektóre, jak bilbile ogrodowe, mieszkają tu na stałe. Inne, na przykład łyski i szpaki, spędzają tu zimę, korzystając z łatwo dostępnego jedzenia w stawach rybnych i na polach. Dwa razy w roku miliony ptaków wędrują wzdłuż terytorium Izraela, wprawiając w zachwyt ornitologów-amatorów. Trzmielojady, pelikany i inne ptaki wędrowne zapełniają niebo w marcu i październiku. W Izraelu gniazduje kilka gatunków ptaków drapieżnych – orły, sokoły i jastrzębie, a także niewielkie ptaki śpiewające – pokrzewki i mysikróliki.
Wzgórzami wędrują delikatne gazele górskie; w lasach żyją lisy, chausy (koty trzcinowe) i inne ssaki; przez pustynne rozpadliny przeskakują obdarzone imponującymi rogami koziorożce nubijskie. Wśród 100 występujących w Izraelu gatunków gadów są kameleony, węże i agamy.