Ważną rolę w izraelsko-polskich relacjach dwustronnych odgrywa wymiana handlowa. Od czasu wznowienia stosunków dyplomatycznych nastąpiło znaczące pogłębienie i poszerzenie zakresu współpracy gospodarczej. W 1991 roku weszło w życie kilka porozumień ułatwiających handel polsko-izraelski m.in. podpisano porozumienie o wspieraniu i obustronnej ochronie inwestycji oraz porozumienie o unikaniu podwójnego opodatkowania. W 1997 roku zawarto także istotną umowę o wolnym handlu, ułatwiającą wymianę handlową. Pozostawała ona w mocy do 2003 roku, kiedy rozwiązała ją strona polska.
Wiele izraelskich firm inwestuje w Polsce, oprócz tego Izrael eksportuje do Polski sprzęt elektroniczny, maszyny, materiały chemiczne oraz towary medyczne. Łączna wysokość eksportu wyniosła w 2015 roku 329 mln USD (dane GUS). Z drugiej strony Polska sprzedaje w Izraelu towary o wartości 466 mln USD (w 2015 roku), głównie produkty spożywcze, maszyny i pojazdy.