以色列位於中東地區，東部沿海是地中海，周邊的國家包括黎巴嫩、敘利亞、約旦和埃及。以色列也是三大洲的交匯地：歐洲、亞洲和非洲。
以色列地域狹長，長290英里（470公里），最寬處85英里（135公里）。儘管面積很小，以色列擁有大陸的各種地域特徵，從森林高地到富饒的綠谷，再到山區沙漠，從沿海平原到半熱帶約旦河谷和地球的最低點死海。國家大約一半的面積為半乾旱土地。
以色列氣候日照充足，雨季從11月至4月，北部年降水量20-30英寸（50-70厘米），南部1英寸（2.5厘米）。各地區氣候情況迥異，在沿海一帶，夏季潮濕，冬季溫暖；在山區，夏季乾燥，冬季適度寒冷；在約旦河谷，夏季炎熱乾燥，冬季氣候宜人；南部半乾旱氣候，白天炎熱，夜晚涼爽。
以色列動植物資源豐富，種類繁多，這多少是由於它的地理位置和氣候的多樣性決定的。在以色列國內，至今發現有500多種鳥類，200多種哺乳動物和爬行動物，2600種植物（其中150種屬於以色列本土植物）。全國已建立了150多個自然保護區和65個國家公園，佔地面積約為400平方英里（差不多1000平方公里）。
由於該地區缺水，現有水資源得到充分利用，並尋找新的水資源。六十年代，以色列淡水資源網的主要水源來自北方，這裡的水被輸送到中部和南部半乾旱地區。正在運行的新水資源水利項目包括人工降雨、污水循環利用和海水淡化。