​在未來幾年中，以色列博物館將斥資8,000萬美元進行翻建。這項將持續多年的翻建工程將新建8萬平方英尺的建築，20萬平方英尺的展廳將被重新佈置、裝修並擴建。博物館翻建工程預計將於2010年5月完工，慶祝建館45週年。

特拉維夫藝術博物館(建於1932年)，現館址是1971年開放的，設有中心畫廊，綜合收藏了古典和現代藝術品，特別是以色列藝術；館內設有青少年館；還設有定期舉辦朗誦會、室內音樂會和藝術影片的禮堂；此外，還有許多展廳可供舉辦短期展覽。海倫娜·魯賓斯坦現代藝術展覽館也隸屬這個博物館。

藝術之家(建於1934年)，位於艾因·哈羅德基布茲，這是國內第一座鄉村博物館，也是基布茲運動的第一個藝術博物館，收藏著大量世界各地猶太人的繪畫、雕塑和民間藝術。這裡經常舉辦短期專題展覽，並進行各種教育項目與研究。

海法博物館(建於1949年)，它集2個展館於一座建築之中：古代藝術館，專門展覽以色列和地中海流域的考古發現和現代藝術館(建於1951年)，展出世界各地(從18世紀中葉至今)的藝術品；這個博物館屬下還有史前陳列館、國家海事陳列館和季科京日本藝術陳列館。陳列館空間雖小但佈置精當，臨時展和常年展都有舉辦。

以色列故土博物館(建於1953年)位於拉馬特阿維夫，其綜合性館藏反映了這一地區考古學、人類學和歷史學方面的發現。館內分別展出玻璃器皿、陶器、鑄幣、民俗、銅器等，此外，還設有天文館。 "男人和手藝"這部分展覽，展出了古代編織、珠寶和陶器的製作工藝以及研磨穀物和烤麵包的方法。博物館還包括一個挖掘出來的泰爾·考西爾洞穴遺址，裡面有12層明顯的人類文明遺跡。博物館屬下還有特拉維夫-雅法歷史陳列館和獨立大廳，1948年以色列建國就是在獨立大廳宣布的，這兩處都位於特拉維夫市中心。

伊斯蘭LA邁爾藝術學院(建於1974​​年)設在耶路撒冷，收藏了種類繁多的永久性展品，有陶器、紡織品、珠寶、各種儀式用品等等，囊括了從西班牙到印度的上千年的伊斯蘭藝術。博物館還經常舉辦各種專題的短期展覽。

散居世界各地的猶太人博物館(建於1978年)坐落在特拉維夫大學校園內，它利用現代技術和視聽裝置追溯各個時代散居世界各地的猶太社團的歷史。在這座非人工製品的博物館內，展品是按主題安排的，每層樓都有一個研究區。該館還舉辦以猶太人為主題的短展覽，有一個以視聽手法按年代表述猶太人歷史的展覽，還有定期舉辦的範圍廣泛的教育和文化項目以及巡迴展覽。

耶路撒冷大衛塔歷史博物館(建於1988年)坐落在城堡遺跡即這座城市的一個重要的歷史和考古遺址上，收藏了第一聖殿時期(公元前960-586年)以來的文物、哈斯蒙尼王朝時期(公元前1世紀)的塔和城牆的部分遺跡，以及希律王(公元前37-4年)建造的巨塔地基。這個非人工製品博物館概括了耶路撒冷這座城市從最初作為迦南人的城市到現在的4000年的歷史。展覽按各個時期劃分，每個展室都順著一條"時間主線"來描述主要事件，此外還運用地圖、錄像帶、全息圖、圖畫和模型等方式來加強展覽效果。臨時展不一定具有主題，有時會藉助展館漂亮的環境展出雕塑、裝置藝術和其他作品。