政府和公共机构是研究与开发经费的主要来源，为以色列半数以上的研究与开发活动提供了财政支助。这些用于民用研究与开发目的经费大部分用于经济发展，主要是用于工业和农业领域，与其他国家相比，占整个研究与开发活动费用的比例很大；40%以上的经费是通过国家、国家之间和政府的研究基金以及通过高等教育委员会管理的综合大学基金对各大学的拨款用于增进科技知识项目。其余的则专门用于各种卫生保健与社会福利领域。
以色列80%以上可以发表的研究项目—以及几乎所有的基础研究项目和基础研究培训—都是在大学中进行的。独立的法人实体—以色列科学基金会（ISF）是对有竞争力的基础研究提供资金的主要来源。大约有1,000名研究人员个人从ISF得到资助，可与从大学基金获得资助的人数相媲美。ISF还为诸如以色列参与欧洲核子研究委员会大型强子对撞机阿特拉斯探测器的制造，以及参与通过新设系列“医师-研究人员”专项拨款提高临床研究质量等特别项目提供资金。
对于单一机构难以解决的大型研究计划的经费和协调问题，往往由TELEM处理。TELEM是一个由工业和贸易部以及科学和技术部的首席科学家、以色列科学院的主席和高等教育委员会、财政部等机构的代表组成的民间论坛。以色列加入欧盟框架计划、以色列成为欧洲同步加速器实验室成员，以及以色列最近的互联网二期计划，都是在TELEM的指导（必要时在经费方面给予帮助）下完成的。目前，TELEM正在考虑在纳米技术领域作新的尝试。
以色列的大学获得的大量专利是衡量大学与产业部门之间关系所带来的效益的一个尺度。
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Photos courtesy of the Weizmann Institute of Science |
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大学的研究与开发
与世界上其他国家中的大学一样，以色列各大学中研究人员的主要目标是增进基础科学知识。由以色列人著述的书籍和期刊涉及所有的科学领域，是大学部门成果的主要体现；以色列的科学出版物在世界出版物中占据了相当大的比例（大约占到1%）。在诸如化学和计算机科学等许多领域，以色列的出版物对世界科学界更是具有特殊的影响力。
以色列在自然科学、工程、农业和医学领域里出版著作的人数，在其劳动大军中的比例大大高于任何其他国家；以色列科学家与其他国家科学家合著的出版物在该国的出版物中占据着相当高的份额。
为了使以色列科学界与国际科学界融为一体，以色列鼓励人们参加国际上的科学会议，同时也鼓励去国外进行博士后研究，以及利用假期去国外工作。以色列在研究机构、大学和政府级别上还与海外的相应组织保持着广泛的交流计划和合作项目。以色列也是举办国际科学会议的重要中心，每年都要主办许多次这样的会议。
大学在开展自身的科研活动的同时，继续在促进以色列的技术进步中发挥重要的创新作用。魏茨曼科学研究所是世界上最先建立组织机构(1958年)、负责把自己的研究成果转化为商业用途的研究所之一；目前在以色列所有的大学中都建立了类似的组织。这些毗邻大学校园建立起来的以科研为基础的工业园区，率先获得了巨大的商业成功。这些大学还常常与国内外企业合作，建立起将自己的科研成果转化为特定商品的附属工业企业。
跨学科的研究和试验机构正在大学里的对国家工业至关重要的各种科学与技术领域发挥着作用，它们作为国家的一些应用研究与开发中心，为诸如建筑、运输、教育等领域服务。除此以外，有很大比例的大学教员以顾问身份为产业部门提供技术、行政、财务和经营管理方面的咨询服务。
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