· 两国民航管理局谅解备忘录 (1992年3月)
· 贸易、税收和投资保护协议 （1992年10月）
· 农业合作谅解备忘录 （1993年）
· 文化交流协议 （1993年5月）
· 互设总领馆协议 （1993年10月）
· 民用航空协议 （1993年10月）
· 旅游业合作协议 （1994年6月）
· 海关行政互助及合作协议 (1997年2月）
· 中以文化交流实施计划 1999-2001（1998年11月 ）
· 中华人民共和国教育部与以色列国在工业技术研究及开发领域合作框架协议
（2000年4月）
· 中华人民共和国教育部与以色列国教育部教育合作协议 （2000年4月）
· 中以节水灌溉和水资源管理合作谅解备忘录 (2001年2月)
· 中以示范奶牛场技术合作谅解备忘录 (2001年2月)
· 中以旱作农业示范培训中心谅解备忘录 (2002年8月)
· 以国际合作中心与中国科协对外应用技术交流促进会签署科技培训合作协议(2004年8月）
· 以中两国政府签署第二号财政合作议定书 (2004年11月)
· 清华科技园与以色列工业研发中心签署合作意向书 (2005年5月)